物流管理的组织结构需要企业根据自身的规模、战略、技术和生产方式选择实际的组织结构。在企业物流发展过程中，逐渐形成了以下四种典型的物流管理组织模式：（1）协同管理组织。目前，我国少数物流过程已经实现了单一领导机构对整个物流过程的领导，但大部分还处于分工状态。在国外，由于物流过程太长、范围太大，很多物流过程不可能实现单一组织的领导。必须是多部门、多企业、多环节的合作。因此，有必要建立一个有效的合作管理组织。合作经营组织主要有两种形式：建立联合领导组织；以委托、分包形式建立以委托人为中心的合作领导体制。
（2）直接管理组织。直接管理物流是许多以利润为中心的物流企业和物流利润源的共同管理体系。在这种管理体制中，物流是企业中对总经理直接负责的行政部门。具有独立开展活动的能力。实际上，它是公司的业务部门。（3）分散管理组织。在大型或巨型企业中，由于企业规模庞大，每个领域都有自己的物流功能，有物流组织来满足子领域对物流的需求。各子领域的物流活动对该领域的主体运作起着支撑和保障作用，与各领域的主体活动密切相关。因此，这些领域的物流活动不可能在这个领域内分离，物流管理必须分散在各个领域，企业只能实行分散管理。
（4）后勤辅助组织。物流子公司是大型或巨型企业，在总公司等业务单位下设子公司，并与该子公司共同成为巨型企业或企业集团的企业联合体成员。子公司比公司内的业务单元更为独立，是典型的“利润中心”物流企业。子公司、总公司与其他公司之间的关系，可以采取一般联合、相互持股、甚至总公司控股的形式。
